Каллум Линч, приговорённый к смертной казни преступник, неожиданно оказывается в лаборатории могущественной корпорации «Абстерго», где учёные используют технологию «Анима» для воссоздания генетической памяти. В сознании Каллума оживает Испания XV века и его предок — ассасин Агилар, который сражается против тамплиеров за обладание Яблоком Эдема. Этот артефакт способен управлять свободой воли человечества, и корпорация стремится заполучить его, чтобы установить контроль над массами. Погружаясь в прошлое, Линч постепенно перенимает боевые навыки и идеологию древнего ордена, разрываясь между холодной жестокостью современности и страстной борьбой за веру. Фильм соединяет мрачную футуристичную эстетику с масштабными паркурными сценами и философским противостоянием двух вековых идеологий — радикальной свободы против диктатуры порядка. Испытания прошлого превращают убийцу в героя, которому предстоит сделать необратимый выбор.